在海鮮池定做的過程中，過濾材料的選擇的必不可少的一個重要環節，海鮮池定做中的過濾材料包括了物理性過濾材料、非生物性過濾材料、化學性過濾材料三種選擇。
物理性過濾材料
過濾棉：過濾棉是海鮮池定做使用最為廣泛的一種過濾材料。它屬于化纖制品.外.表像一片棉花。用于初級過濾主要起物理過濾作用，需要經常清洗。發現破損、疏松時要及時吏換。使用過濾棉.具有價格低廉、物理過濾效果好的優點。
非生物性過濾材料
生化棉：生化棉外表像海綿.但孔隙比海綿大.可用于培養更多的硝化細菌。生化棉主要用十物理過濾和生物過濾，因此不能經常清洗，隔一段時間做一次表面清潔即可。清洗的時候要用原水族箱的水適當搓洗即可。
生化培養球(生化球)：生化培養球由于表面積較大且多孔，所以適合硝化細菌的生長和水流分散通過。使用生化球時，不可將其浸沒在水中，否則會造成硝化細菌因氧氣不足而影響繁殖。由于生化培養球的主要作用是進行生物過濾，所以不用經常清洗，而且必須和具有物理過濾性質的濾材配合使用，且應先利用物理過濾將水中大顆粒廢物濾除后，再經生化球進行生物過濾。一般在滴流過濾器中使用較多。
化學性過濾材料
活性炭：海鮮池定做使用的活性炭的外觀很像黑色的石粒。活性炭由于內部有很多黑色的小孔，所以有吸附功能，可以脫色和除臭，且具有良好的吸氨作用。此外，活性炭還有助十提高水體ph值。活性炭使用之前要反復清洗.以免夾雜的黑色粉末進人養殖水體。
沸石(吸氨石)：由于沸石內部具有多孔結構，所以有良好的吸氮作用，不僅起到化學過濾的作用。而且有利于提高水體ph值。此外，它內部的空隙還可附著大量的硝化細菌。所以還可以起到生物過濾作用。